硫離子對UASB厭氧反應器及IC厭氧反應器甲烷消化有毒害作用，硫離子的來源有三種。

(1)硫化堿等原料的應用，直接帶人水中。

(2)由無機硫酸鹽還原而來，如通過以下反應：

S〇₄ ^2-+8H ⁺→ S^2- +4H₂O

SO₃^2- +6H ⁺ → S^2- +3H₂O

硫酸鹽還原時作為氫受體釋出S^2-，硫酸鹽濃度超過5000mg/L， 即有抑制作用。而且，從反應方程式可知，1mol SOI還原時用 去8mol H⁺，將少產生2mol CH₄，lmol SO₃^2-還原時用去6mol H⁺，減少 1. 5mol CH₄。

(3)  由蛋白質分解釋放出S^2-。硫元素對微生物有正反兩方面的影響。有利方面是，低濃度硫是細菌生長所需要的元索，可促進消化進程；硫直接與重金屬絡合形成硫化物沉淀。有害方面是．若重金屬離子較少，則消化液中過多的 H₂S 將釋放出進人消化氣中，降低消化氣的質量并腐蝕金屬設備（管道、鍋爐等）；降低 CH ₄的產量。另外，硫酸鹽的存在將促進硫酸鹽還原菌的作 用 ，而硫酸鹽還原菌與產甲烷菌之間會有一定程度的競爭，使產甲烷作用受到抑制